这是我制作的第三个R包，原因就很简单了，因为懒^-^
qqdeg！
一键获得DEG和enrich!
安装
install.packages("devtools")
library(devtools)
如果连接失败：
1.尝试修复Hosts配置
2.尝试Win+R，输入inetcpl.cpl 直接打开Internet选项。打开后，在高级中勾选使用TLS 1.0、使用TLS 1.1、使用TLS 1.2、使用TLS 1.3。
devtools::install_github('liuyuchenlab/qqdeg')
library(qqdeg)
数据格式
可以直接承接TECOUNTS的counts矩阵，选择gene或者te即可，其他软件的gene定量选gene即可
示例代码，自己用的，只能用xlsx文件，处理小鼠数据，想用其他物种，或者改其他参数可以改下代码，非常方便 。
第一个是实验组，第二个是对照组，fc是foldchange，默认是1.5，result里存有很多对象，GO和KEGG默认p.adj < 0.05，删除重复项。
result <- qqdeg("rlim.xlsx","gene","female-ko","female-wt",fc_threshold = 1.5)
